基于cDNA-AFLP技术分析不同种源和地域太子参基因差异表达

doi:10.16333/j.1001-6880.2016.2.004

天然产物研究与开发 ›› 2016, Vol. 28 ›› Issue (2): 188-194.doi: 10.16333/j.1001-6880.2016.2.004

基于cDNA-AFLP技术分析不同种源和地域太子参基因差异表达

华愉教，耿超，王胜男，刘训红*，谷巍，罗益远，刘娟秀，侯娅，马阳

南京中医药大学，南京 210023

出版日期:2016-02-29 发布日期:2016-03-07

Analysis of Gene Expression of Pseudostellariae Radix from Different Provenances and Habitats Based on cDNA-AFLP

HUA Yu-jiao,GENG Chao,WANG Sheng-nan,LIU Xun-hong*,GU Wei,LUO Yi-yuan,LIU Juan-xiu,HOU Ya,MA Yang

Nanjing University of Chinese Medicine,Nanjing 210023,China

Online:2016-02-29 Published:2016-03-07

摘要/Abstract

摘要： 研究不同种源和地域太子参的基因差异表达，分离并鉴定相关差异基因。采用cDNA-AFLP 技术分析2个不同种源和地域太子参差异表达基因。筛选6个引物组合进行扩增，从同种源不同地域及同地域不同种源太子参中分别获得44、38条差异表达转录衍生片段（Trivially distributed file system,TDFs），对差异片段进行克隆、序列测定，分别得到27、25个TDFs核苷酸序列。经过BLASTX程序比对，分别有19、16个TDFs有其对应的显著同源序列，其中有7、6个TDFs为已知功能的蛋白，这些蛋白主要参与植物的生长发育、抵御病虫害、提高植物抗非生物胁迫的能力。本研究为揭示太子参药材品质形成的分子机制提供基础资料。

关键词: 太子参, 种源和地域, cDNA-AFLP, 差异表达基因

Abstract: The aim of this study was to investigate gene differential expression in Pesudostellariae Radix from different provenances and habitats,as well as to isolate and evaluate associated differential genes.cDNA-AFLP was applied to analyze the differential expressed genes of Pesudostellariae Radix from two different provenances and habitats.Six primer pairs were selected,using these primer pairs,44 and 38 differentially expressed trivially distributed file system (TDFs),were amplified in Pesudostellariae Radix from same provenances and different habitats as well as same habitats and different provenances,respectively.These TDFs were cloned and sequenced,27 and 25 nucleotide sequences were obtained,respectively.By BLASTX analysis,19 and 16 of them were found with homologous sequences in databases,of which,7 and 6 TDFs had their known function,respectively.These proteins were mainly involved in the growth and development of plants,resisting diseases and insect pests,improving the ability of plants to resist the abiotic stress.Our research provided the basic information for revealing the molecular mechanism of Pesudostellariae Radix.

Key words: Pesudostellariae Radix, provenances and habitats, cDNA-AFLP, differential expressed genes

中图分类号:

R917

华愉教，耿超，王胜男，刘训红*，谷巍，罗益远，刘娟秀，侯娅，马阳. 基于cDNA-AFLP技术分析不同种源和地域太子参基因差异表达[J]. 天然产物研究与开发, 2016, 28(2): 188-194.

HUA Yu-jiao,GENG Chao,WANG Sheng-nan,LIU Xun-hong*,GU Wei,LUO Yi-yuan,LIU Juan-xiu,HOU Ya,MA Yang . Analysis of Gene Expression of Pseudostellariae Radix from Different Provenances and Habitats Based on cDNA-AFLP[J]. NATURAL PRODUCT RESEARCH AND DEVELOPMENT, 2016, 28(2): 188-194.

[1]	曾丽, 甘思言, 杜蓥蓥, 乔石, 张炎达, 王全溪, 黄一帆, 马玉芳. 太子参参须皂苷的免疫佐剂作用研究[J]. 天然产物研究与开发, 2022, 34(6): 934-940.
[2]	荣旺, 朱占兰, 宋亚一. 生物信息学方法下糖尿病微血管并发症关键基因与通路筛选及中药预测研究[J]. 天然产物研究与开发, 2022, 34(10): 1774-1783.
[3]	曾丽, 陈赛红, 甘思言, 杜蓥蓥, 张炎达, 黄一帆, 马玉芳. 太子参参须皂苷对RAW 264.7细胞体外免疫调节作用研究[J]. 天然产物研究与开发, 2022, 34(10): 1657-1665.
[4]	胡晓峰, 柴海全, 贾林川, 邵露, 刘晓晓, 陈野. 一株太子参内生真菌Aspergillus terreus TZS-201607中抗肿瘤活性代谢产物研究[J]. 天然产物研究与开发, 2021, 33(7): 1156-1164.
[5]	阿力米江·奥布力塔力甫, 马建宝, 伊再提·外力, 古丽巴哈尔·卡吾力. 基于生物信息学探讨黑果枸杞总黄酮治疗非酒精性脂肪肝的作用机制[J]. 天然产物研究与开发, 2021, 33(12): 2119-2135.
[6]	衣伟萌, 陈赛红, 闵思明, 陈俊宇, 甘思言, 黄一帆, 张炎达, 马玉芳. 太子参参须提取物对免疫抑制小鼠免疫保护作用的研究[J]. 天然产物研究与开发, 2020, 32(5): 837-844.
[7]	华愉教，谢芬，周少丹*，王敏伟，仰晓云，陆元杰. 基于HPLC-Q-Exactive Orbitrap/MS技术分析不同剂型太子参的差异化学成分[J]. 天然产物研究与开发, 2020, 32(2): 257-268.
[8]	王俊丽, 王龙, 欧阳湖, 焦松林, 任建国. 太子参内生真菌NSZJ-1抗氧化活性的初步研究[J]. 天然产物研究与开发, 2020, 32(11): 1920-1927.
[9]	张春丽1,2，徐国波1,2，刘俊1,3，廖尚高1,2,3，何迅2,4*. 太子参化学成分研究[J]. 天然产物研究与开发, 2017, 29(7): 1132-1135.
[10]	檀新珠，陈语嫣，陈赛红，廖吕燕，黄一帆，马玉芳. 太子参茎叶多糖对免疫抑制小鼠免疫功能的影响[J]. 天然产物研究与开发, 2017, 29(12): 2134-2140.
[11]	马阳，侯娅，邹立思，刘训红*，罗益远，刘娟秀. 不同种质和地域太子参氨基酸柱前衍生HPLC测定及多元统计分析[J]. 天然产物研究与开发, 2016, 28(8): 1192-1198.
[12]	夏和先1,2,3，陈乃东1,2*，姚厚军1,2，王海军1，柯成1，孙叶超1. 不同种源的太子参多糖含量及其单糖组成GC-MS研究[J]. 天然产物研究与开发, 2016, 28(4): 542-546.
[13]	侯娅，马阳，邹立思，刘训红*，罗益远，刘娟秀 . 基于气相色谱-质谱的闽产太子参挥发性成分动态变化研究[J]. 天然产物研究与开发, 2016, 28(3): 371-376.
[14]	华愉教，侯娅，王胜男，刘训红*，邹立思，谷巍，罗益远，刘娟秀 . 基于¹H NMR代谢组学技术的传统产区与种植基地太子参化学成分分析[J]. 天然产物研究与开发, 2016, 28(10): 1510-1516.
[15]	安坤，何静，万忠民，阳小成，焦威. 不同产区太子参氨基酸含量测定及多元统计分析[J]. 天然产物研究与开发, 2012, 24(5): 594-598.

基于cDNA-AFLP技术分析不同种源和地域太子参基因差异表达

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